AIKraft/AI/Войти
AIKraft/Skills/tooluniverse-gene-enrichment

tooluniverse-gene-enrichment

Анализ обогащения генных множеств — GO (биологический процесс, молекулярная функция, клеточный компонент), KEGG, обогащение путей Reactome с помощью clusterProfiler, gseapy, ORA, GSEA. Применяется для интерпретации списков дифференциально экспрессированных генов (DEG), списков хитов скрининга или любых запросов «список генов — пути». Включает обработку параметров simplify-cutoff и соглашения о знаменателях union-vs-total для вопросов о проценте DE-генов.

mims-harvard official Разработка

Что делает навык

Анализ обогащения генных множеств — GO (биологический процесс, молекулярная функция, клеточный компонент), KEGG, обогащение путей Reactome с помощью clusterProfiler, gseapy, ORA, GSEA. Применяется для интерпретации списков дифференциально экспрессированных генов (DEG), списков хитов скрининга или любых запросов «список генов — пути». Включает обработку параметров simplify-cutoff и соглашения о знаменателях union-vs-total для вопросов о проценте DE-генов.

Как подключить

1Скачать навык
# возьмите папку навыка «tooluniverse-gene-enrichment» из репозитория: # https://github.com/mims-harvard/tooluniverse
2Положить папку с SKILL.md к навыкам ассистента
# положите папку навыка туда, где ассистент ищет skills: cp -r tooluniverse-gene-enrichment/ ~/.claude/skills/tooluniverse-gene-enrichment/

Навык — папка с файлом SKILL.md (описание + инструкции) и опциональными скриптами. Ассистент (Claude, Claude Code и совместимые) подхватывает его по описанию и следует шагам.