AIKraft/Skills/scvi-tools

scvi-tools

Глубокое обучение для анализа одноядерных/одноклеточных данных с использованием scvi-tools. Этот навык следует использовать, когда пользователям нужно: (1) интеграция данных и коррекция батчей с помощью scVI/scANVI, (2) анализ ATAC-seq с помощью PeakVI, (3) мультимодальный анализ CITE-seq с помощью totalVI, (4) анализ multiome RNA+ATAC с помощью MultiVI, (5) деконволюция пространственной транскриптомики с помощью DestVI, (6) перенос меток и отображение на референс с помощью scANVI/scArches, (7) оценка скорости транскрипции (RNA velocity) с помощью veloVI или (8) любой метод глубокого обучения для одноклеточных данных. Триггеры включают упоминания scVI, scANVI, totalVI, PeakVI, MultiVI, DestVI, veloVI, sysVI, scArches, variational autoencoder, VAE, batch correction, data integration, multi-modal, CITE-seq, multiome, reference mapping, latent space.

anthropics official Данные

Что делает навык

Глубокое обучение для анализа одноядерных/одноклеточных данных с использованием scvi-tools. Этот навык следует использовать, когда пользователям нужно: (1) интеграция данных и коррекция батчей с помощью scVI/scANVI, (2) анализ ATAC-seq с помощью PeakVI, (3) мультимодальный анализ CITE-seq с помощью totalVI, (4) анализ multiome RNA+ATAC с помощью MultiVI, (5) деконволюция пространственной транскриптомики с помощью DestVI, (6) перенос меток и отображение на референс с помощью scANVI/scArches, (7) оценка скорости транскрипции (RNA velocity) с помощью veloVI или (8) любой метод глубокого обучения для одноклеточных данных. Триггеры включают упоминания scVI, scANVI, totalVI, PeakVI, MultiVI, DestVI, veloVI, sysVI, scArches, variational autoencoder, VAE, batch correction, data integration, multi-modal, CITE-seq, multiome, reference mapping, latent space.

Как подключить

1Скачать навык
# возьмите папку навыка «scvi-tools» из репозитория: # https://github.com/anthropics/knowledge-work-plugins
2Положить папку с SKILL.md к навыкам ассистента
# положите папку навыка туда, где ассистент ищет skills: cp -r scvi-tools/ ~/.claude/skills/scvi-tools/

Навык — папка с файлом SKILL.md (описание + инструкции) и опциональными скриптами. Ассистент (Claude, Claude Code и совместимые) подхватывает его по описанию и следует шагам.